Cryo-EM Uppsala

Kontakt

Cryo-EM Uppsala erbjuder skräddarsydda lösningar för alla användare, oberoende av tidigare erfarenhet. Kontakta oss på: cryoem-icm@uu.se

Anna Sundborger-Lunna, PhD, Föreståndare
anna-sundborger-lunna@icm.uu.se 
Tel: 076-0472807

Daniel Larsson, PhD, Kryo-EM expert 
daniel.larsson@icm.uu.se 
Tel: 018-471 4601

Utrustning och tjänster 

Cryo-EM Uppsala möjliggör kryo-EM-arbetsflödet för partikel analys (single particle analysis).

Prov preparation 

A picture containing dark, kitchen applianceDescription automatically generatedEn Mark IV Vitrobot (Thermo Fisher) finns för vitrifikation av prover för kryo-EM-analys. Prover kan antingen utvärderas och analyseras lokalt eller skickas till annan facilitet för datasamling (t.ex. SciLife i Solna). 


Product Image

Utvärdering av prover och datasamling 

Ett 200kV Glacios elektronmikroskåp med en Falcon III direkt elektrondetektor finns tillgängling för effektiv snabb-analys av vitrifierade gridder samt för datasamling. Elektronmikroskåpet är utrustat med en autoloader som möjliggör analys av upp till 12 prover under 3 dagar. Falcon III elektrondeterktorn samlar ca 40 filmer/timmer beroende på prov samt inställningar. 

Dataanalys och 3D rekonstruktion 

Cryo-EM Uppsala get möjlighet till direkt-analys av data under insamling för optimering av prover. Vi erbjuder även infrastruktur för 3D rekonstruktion och modell-byggande med hjälp av olika mjukvarupaket, inklusive Cryosparc, Relion, COOT och Chimera.Relion for Cryo-EM Solutions | NVIDIA GPU Systems | Exxact

Start ett nytt project/Boka prepration och analys 

Cryo-EM Uppsala erbjuder skräddarsydda lösningar baserade på projektets mål samt användarens tidigare erfarenhet av kryo-EM. Fyll i blankett(er) och skicka till: cryoem-icm@uu.se

Utbildning 

Cryo-EM Uppsalas mål är att tjäna både nya och erfarna kryo-EM-användare vid Uppsala universitet med omnejd. Erfarna användare kommer att få möjlighet till självständigt arbete efter en kort introduktion, medan nya användare kommer att erbjudas workshops och andra utbildningstillfällen. Vänligen kontakta oss på cryoem-icm@uu.se för mer information!

Kostnad 

Användaravgift baseras på användarens affiliering samt tidigare erfarenhet. 

  • Niva 1: Ny/oerfaren användare som behöver assistans från personal. 
    • Vitrobot 1: sek/timme 
    • Glacios 1: sek/dag

  • Niva 2: Erfaren användare som inte behöver assistans från personal. 
    • Vitrobot 2: sek/timme 
    • Glacios 2: sek/dag

SLACK 

Du hittar oss här: cryo-emuppsala.slack.com

Senast uppdaterad: 2021-10-27